稽查局是國家稅務總局主管稅務稽查工作的職能部門。主要職責是：起草稅務稽查法律法規草案、部門規章及規范性文件；辦理重大稅收案件的立案和調查的有關事項并提出處理意見；指導、協調稅務系統的稽查工作。

內設處室：

綜合處、制度處、案源管理處、組織檢查一處、組織檢查二處、組織檢查三處、組織檢查四處、合作協調處、涉稅違法聯合懲戒管理處、質效管理處、公安部聯絡室。